Biotuotteiden ja biotekniikan laitos

Bioprosessitekniikka

Professori Rahul Mangayilin johtama Bioprosessitekniikan tutkimusryhmä tutkii pääasiassa Komagataeibacter-suvun bakteerien, eli luontaisten nanoselluloosan tuottajien geneettisiä perusominaisuuksia kehittääkseen "älykkäitä" toiminnallisia eläviä materiaaleja. Lisäksi kehitämme ympäristöystävällisiä bioprosesseja bakteerien nanoselluloosan tuotantoon sekä suunnittelemme synteettisen biologian työkaluja Komagataeibacter-lajeille.
Colour photo of a blurry person in a white lab coat holding an in-focus white paper-like wafer in their blue gloved hand
Postdoc-tutkija Michelle Alexandrino de Assis pitää kädessään materiaalinäytettä. Kuva: Jose Luis González Arribas.

Tutkimusalueemme

  • Rekombinanttien proteiinien eritys Komagataeibacter-lajien omien ja heterologisten moduulien avulla
  • Toiminnallisten elävien materiaalien kehittäminen mikromuovien depolymerointiin
  • Bioprosessien kehittäminen ja bioprosessitekniikka
  • C1-yhdisteiden biologinen muuntaminen peruskemikaaleiksi

Lisätietoja

Lue tarkemmin tutkimusryhmän toiminnasta ryhmän englanninkielisiltä sivuilta.

Engineering surface display in Komagataeibacter to design new ‘smart’ biomaterials (2025 - 2028, CIMANET doctoral school funded by the Research Council of Finland)

This project develops genetic surface-display tools in Komagataeibacter to enable in situ functionalization of bacterial cellulose. By programming cell-surface interactions during material biosynthesis, the work aims to create smart, responsive, and multifunctional biomaterials with applications in engineered living materials.

Recombinant protein display on Komagataeibacter cell surface
Recombinant protein display on Komagataeibacter cell surface
Microscopy analysis of recombinant protein secretion in Komagataeibacter spp.
Microscopy analysis of recombinant protein secretion in Komagataeibacter spp.

Developing in silico pipelines to track IS mobilization in Komagataeibacter via population-level sequencing (2024 - 2027, CYSS doctoral school funded by Jenny and Antti Wihuri Foundation)

The project develops in silico analysis pipelines for population-level sequencing to map and understand genome flexibility of Komagataeibacter spp. under agitated conditions. The resulting frameworks enable predictive assessment of genome stability and engineerability in biomaterial-producing bacteria.

Publications/preprints

Davide Bersanetti, Mangayil, R. (2025). Exploring Genome-Wide Mutation Dynamics and Bacterial Cellulose Impairment in Komagataeibacter intermedius Cultivated Under Agitation Stress.bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2025.10.09.681338

Population-level genome dynamics of Komagataeibacter grown under agitated conditions
Population-level genome dynamics of Komagataeibacter grown under agitated conditions

Metabolic landscape of acetogenic Clostridia under mixotrophic fermentation (2024 - 2027)

This project maps the metabolic landscape of acetogenic Clostridia during mixotrophic fermentation, integrating gas and biomass-derived substrates to understand pathway regulation, guiding process optimization for sustainable biochemical production.

Publications/preprints

Kumar, S., Nousiainen, P., Kamravamanesh, D., Mangayil, R. (2026). Integrated multi-analytical framework for comprehensive characterization of lignocellulosic hydrolysates for biorefinary applications. Biomass and Bioenergy, 207, 108754. (https://doi.org/10.1016/j.biombioe.2025.108754)

Mixotrophic fermentation using acetogenic Clostridia
Mixotrophic fermentation using acetogenic Clostridia
  • Päivitetty:
  • Julkaistu:
Jaa
URL kopioitu