Aalto-yliopiston joukkueille menestystä aineenvaihduntatuotteiden tunnistamiseen keskittyneessä CASMI-kilpailussa
Aineenvaihduntatuotteiden yleinen tunnistusprosessi
Aineenvaihduntatuotteet ovat pieniä molekyylejä, joiden avulla voidaan saada tietoa solujen tilasta. Kilpailu molekyylien tunnistamisesta massaspektrometridatasta järjestettiin keväällä 2016. CASMI-kilpailun tavoitteena oli luoda yhteinen kehys aineenvaihduntatuotteiden tunnistamismenetelmien arvioimiseen.
Tänä vuonna arvioitiin ensimmäistä kertaa myös automaattisia menetelmiä. Tavoitteena oli määritellä oikea molekyylirakenne noin 200 erilaisen mahdollisen rakenteen joukosta.
Automaattisen menetelmän kategoriassa lisäinformaatiota sai käyttää ainoastaan ennustemallin opettamiseen. Kategorian voitti Aalto-yliopiston ja saksalaisen Jenan yliopiston tutkijoista muodostettu Brouardin joukkue, ja sen jäseninä olivat Céline Brouard, Huibin Shen, Kai Dührkop, Sebastian Böcker ja Juho Rousu. Kategoriassa toiseksi tuli Dührkopin joukkue, jonka jäseniä olivat Kai Dührkop, Huibin Shen, Sebastian Böcker ja Juho Rousu.
Lisätietoja:
Critical Assessment of Small Molecule Identification (CASMI) -kilpailu
Lisätietoa Brouardin joukkueen käyttämästä menetelmästä, Bioinformatics
Lisätietoa Dührkopin joukkueen käyttämästä menetelmästä
Lue lisää uutisia

Hyvinvointireitti aukeaa Otaniemen kampukselle
Reitti avataan 19.4.2023 osana opiskelijoiden mielenterveyspäivää.
Kaikki äitini puhelut on paras lyhytelokuva
Parhaan lyhytelokuvan Jussi-palkinto myönnettiin toista kertaa peräkkäin Aalto-yliopistosta valmistuneen ohjaajan elokuvalle.
Taide herättää kehon tuntemaan
Turun yliopiston ja Aalto-yliopiston tutkimus paljastaa, että taide vaikuttaa voimakkaasti ihmisten kehoon ja tunteisiin.