Uutiset

Aalto-yliopiston joukkueille menestystä aineenvaihduntatuotteiden tunnistamiseen keskittyneessä CASMI-kilpailussa

Joukkueet voittivat ja tulivat toiseksi parhaan automaattisen rakenteellisen tunnistuksen kategoriassa.

Aineenvaihduntatuotteiden yleinen tunnistusprosessi

Aineenvaihduntatuotteet ovat pieniä molekyylejä, joiden avulla voidaan saada tietoa solujen tilasta. Kilpailu molekyylien tunnistamisesta massaspektrometridatasta järjestettiin keväällä 2016. CASMI-kilpailun tavoitteena oli luoda yhteinen kehys aineenvaihduntatuotteiden tunnistamismenetelmien arvioimiseen.

Tänä vuonna arvioitiin ensimmäistä kertaa myös automaattisia menetelmiä. Tavoitteena oli määritellä oikea molekyylirakenne noin 200 erilaisen mahdollisen rakenteen joukosta.

Automaattisen menetelmän kategoriassa lisäinformaatiota sai käyttää ainoastaan ennustemallin opettamiseen. Kategorian voitti Aalto-yliopiston ja saksalaisen Jenan yliopiston tutkijoista muodostettu Brouardin joukkue, ja sen jäseninä olivat Céline Brouard, Huibin Shen, Kai Dührkop, Sebastian Böcker ja Juho Rousu. Kategoriassa toiseksi tuli Dührkopin joukkue, jonka jäseniä olivat Kai Dührkop, Huibin Shen, Sebastian Böcker ja Juho Rousu.

Lisätietoja:

Critical Assessment of Small Molecule Identification (CASMI) -kilpailu

Lisätietoa Brouardin joukkueen käyttämästä menetelmästä, Bioinformatics

Lisätietoa Dührkopin joukkueen käyttämästä menetelmästä

  • Julkaistu:
  • Päivitetty:

Lue lisää uutisia

Kuva: Tima Miroschnichenko, Pexels.
Mediatiedotteet Julkaistu:

Tutkimus: Matalan hierarkian organisaatioissa isoja periaatekysymyksiäkin ratkotaan porukalla Slackissa

Aalto-yliopiston alumni, vieraileva tutkijatohtori Lauri Pietinalho New Yorkin yliopiston Sternin kauppakorkeakoulusta ja Aalto-yliopiston apulaisprofessori Frank Martela selvittivät tuoreessa tutkimuksessa, miten matalan hierarkian organisaatiot käsittelevät yhteisiä toimintaperiaatteita vastakkainasettelutilanteissa ja miten auktoriteetti niissä toimii.
bakteereja ohjataan magneettikentän avulla
Mediatiedotteet, Tutkimus ja taide Julkaistu:

Fyysikot saivat bakteerit uimaan lähes täydellisissä riveissä

Bakteerien ohjaaminen onnistui magneettikentän avulla. Löytö auttaa ymmärtämään bakteeripopulaatioiden käyttäytymistä ja voi jatkossa auttaa esimerkiksi kehittämään uuden sukupolven materiaaleja, joista kaavaillaan apua muun muassa lääkkeiden kohdennettuun kuljettamiseen kehon sisällä.
Ahomansikka
Kampus Julkaistu:

Ihmisten, kasvien ja pölyttäjien kampus

Aalto-yliopiston kampusluontoa hoidetaan monimuotoisuus ja luontotyyppien ominaislajisto huomioiden.
2020 rajanylitykset pohjoismaissa
Mediatiedotteet, Tutkimus ja taide Julkaistu:

Tutkijat loivat ainutlaatuisen ennustemallin kuvaamaan pandemian leviämistä maiden rajojen yli

Pohjoismainen yhteishanke pureutui koronaviruksen leviämiseen vuonna 2020. Tutkimuksen avulla voidaan jatkossa ennakoida paremmin, milloin ja mitkä matkustusrajoitukset ovat pandemiaolosuhteissa tarkoituksenmukaisia.